藤子不二夫A原作の人気漫画「忍者ハットリくん」シリーズの第3弾。サブタイトルになっている「〜科学忍法VS忍の術〜」は本機のために描き起こされたオリジナルストーリーで、メカ忍者のメカマロが率いるメカ忍軍とハットリくんの対決が描かれている。
スペックは大当り確率399.61分の1、確変突入率80%のマックスタイプ。確変「超忍バトルモード」ではハットリくんとメカ忍軍のバトルが展開。ケムマキも助っ人として参加し、囚われた仲間を救っていくストーリーが楽しめるようになっている。超忍バトルモードで敗北すると確変or時短の「メカ忍砦突破モード」へ、また通常時のモード移行から突入する「千載一遇モード」は潜確の可能性があるのでポイントだ。
演出では液晶画面を覆う巨大なハットリくんフェイス役モノ「ニンニンヒーローフェイス」が最大の見どころ。迫力はもちろんだが期待度も抜群だ。その他にも「巨大手裏剣役モノ」や「回転巻物」「電光石火アタッカー」など多種多彩なギミックが搭載されている。